Диференціація та ідентифікація різних генотипів цукрового буряку (Beta vulgaris L.) за допомогою ДНК-маркерів



DOI: http://dx.doi.org/10.31548/dopovidi2016.04.003

O. L. Klyachenko, L. M. Prysiazhniuk

Анотація


Наведено результати досліджень молекулярно-генетичного поліморфізму у генотипів цукрових буряків із використанням RAPD- і SSR-аналізу. Виявлено та проаналізовано 14 алелів за чотирма RAPD-маркерами, встановлена гетерогенність матеріалів за частотою алелів (0,22‑0,67) у досліджуваних генотипів, що свідчить про можливість застосування цих маркерів для генотипування цукрових буряків та визначення ступеня спорідненості між ними. Ідентифіковано п’ять типів алелів для застосування ДНК-маркеру GZM 086, за якими визначено поліморфні генотипи цукрових буряків: Катюша, УЛВ 37, Білоцерківський ЧС 57, Ялтушківський 64, Український ЧС 72. Виявлені алелі можна застосовувати для створення генетичних профілів, що характеризують генетичне різноманіття сортів та гібридів цукрових буряків.

Визначені генетичні дистанції між генотипами у вибірці, які характеризують ступінь подібності досліджених форм. Встановлено, що найбільш подібними виявились генотипи, які належать до одного кластеру за досліджуваними ДНК-маркерами. Визначено, що генотипи із значенням генетичних дистанцій, яке наближається до одиниці є віддаленим за досліджуваним локусом. Встановлено, що з метою ідентифікації та диференціації сортів цукрових буряків доцільно застосовувати визначення міжсортового поліморфізму за використання різних ДНК-маркерів.

В 


Ключові слова


молекулярно-генетичний поліморфізм, RAPD-, SSR-маркери, генотипування

Повний текст:

PDF

Посилання


Velikov, V. A. (2013). Molekulyarnaya biologiya: prakticheskoe rukovodstvo [Molecular biology. Practical guide]. Saratov: Izdatelstvo В«Saratovskiy istochnikВ» [in Russian].

Ermatraut E. R., Prysiazhniuk O. I., Shevchenko I. L. (2007). Statystychnyi analiz ahronomichnykh doslidnykh danykh v paketi STATISTICA 6.0 [Statistical analysis of agronomic research data by program STATISTICA 6.0]. K.: TOV В«PolihrafKonsaltynhВ» [in Ukrainian].

Roik M.V., Syvolap Iu.M., Petiukh H.P., Shaiuk L.V., Bab'iazh A.I., Bilous N.V. (2007). Vyznachennia molekuliarno-henetychnoho polimorfizmu rodu BETA L. za dopomohoiu polimeraznoi lantsiuhovoi reaktsii [Determining of the molecular genetics polymorphisms of genus BETA L. by polymerase chain reaction]. K.: TOV В«PolihrafKonsaltynhВ» [in Ukrainian].

Fedulova, T. P. (2014). DNK-markeryi dlya identifikatsii sortotipov v genofonde sveklyi korneplodnoy [DNA markers for identifying of varieties in the gene fond of sugar beet]. Saharnaya svekla - Sugar beet, 5, 14-16 [in Russian].

Fedulova, T. P., & Fedorin, D. N. (2015). Issledovanie vnutrividovogo polimorfizma sortotipov sveklyi korneplodnoy (Beta vulgaris L.) [Researching of intraspecific polymorphism varieties of sugar beet (Beta vulgaris L.). Vestnik Voronezhskogo gosudarstvennogo agrarnogo universiteta - Bulletin of Voronezh State Agrarian University, 2, 21-24 [in Russian].

Fedulova, T. P. (2009). Perspektivyi ispolzovaniya molekulyarno-geneticheskih markerov v selektsii saharnoy sveklyi [Prospects of using of molecular genetic markers in breeding of sugar beet]. Saharnaya svekla - Sugar beet, 9, 34-37 [in Russian].

Havkin, E. E. (2003). Molekulyarnaya selektsiya rasteniy: DNK-tehnologii sozdaniya novyih sortov selskohozyaystvennyih kultur [Molecular plant breeding: DNA technologies for creation of new crop varieties]. Selskohozyaystvennaya biologiya - Agricultural biology, 3, 26-39.

Dörnte, J. (2011). Entwicklung, Charakterisierung und Kartierungvon Mikrosatellitenmarkern bei der Zuckerrübe (Beta vulgaris L.) [Development, characterization and use of microsatellite markers in sugar beet]. Doktor's thesis. Gatersleben [in German].

Ghasemi, A. R., & Golparvar A. R., & Isfahani M. N. (2014). Analysis of geneic diversity of sugar beet genotypes using random amplified polymorphic DNA marker. Genetika, 3, 975-984.

https://doi.org/10.2298/GENSR1403975G

Holton, T. A., & Henry Ed. R. J. (2001). Plant genotyping by analysis of microsatellites. In: Plant genotyping: The DNA fingerprinting of plants, 15-27.

https://doi.org/10.1079/9780851995151.0015

Izzatulayeva, V., & Akparov, Z., & Babayeva, S., & Ojaghi, J., & Abbasov, M. (2014). Efficiency of using RAPD and ISSR markers in evaluation of genetic diversity in sugar beet. Turkish Journal of Biology, 38, 429-438.

https://doi.org/10.3906/biy-1312-35

Lučić, A., & Isajev, V., & Rakonjac, L., & Ristić, D., & Kostadinović, M., & Babić, V. et al. (2011). Genetic divergence of scots pine (Pinus sylvestris L.) populations in serbia revealed by rapd. Arch. Biol. Sci., Belgrade., 63, 371-380.

https://doi.org/10.2298/ABS1102371L

Möhring, S., & Salamini, F., & Schneider K. (2004). Multiplexed, linkage group-specific SNP marker sets for rapid genetic mapping and fingerprinting of sugar beet (Beta vulgaris L.). Molecular Breeding, 14, 475-488.

https://doi.org/10.1007/s11032-004-0900-4

Roose-Amsaleg, C., & Cariou-Pham, E., & Vautrin D., & Tavernier R., & Sjlignac, M. (2006). Polimorhic microsatellite loci in Linum usitatissimum. Molecular Ecology Notes, 1, 796-799.

https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2006.01348.x

Smulders, M. J. M., & Esselink, G. D., & Everaert, I., & De Riek, J., & Vosman, B. (2010). Characterisation of sugar beet (Beta vulgaris L. ssp. vulgaris) varieties using microsatellite markers. Р’РњРЎ Genetics, 11, 1-11.

https://doi.org/10.1186/1471-2156-11-41

Williams J.G.K., & Kubelik A.R., & Livak K.J. et al. (1990) DNA polymorphism amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucl. Acids Res., 18, 6231-6235.

https://doi.org/10.1093/nar/18.22.6531


Метрики статей

Завантаження метрик ...

Metrics powered by PLOS ALM

Посилання

  • Поки немає зовнішніх посилань.