Генетичні особливості тарпановидних коней породи коник польський та встановлення філогенетичних зв'язків із древніми еквідами за допомогою ISSR-PCR маркерів
DOI:
https://doi.org/10.31548/dopovidi1(101).2023.002Ключові слова:
ISSR-PCR маркери, міжмікросателітні фрагменти ДНК, тарпановидні коні, філогенетичні зв'язкиАнотація
Сучасні підходи до генотипування сільськогосподарських тварин з викорисанням ДНК-маркерів нині з успіхом застосовуються для визначення походження свійських коней і особливостей їх генетичної структури.
Метою нашої роботи є виявлення внутрішньовидової генетичної мінливості тарпановидних коней породи коник польський та встановлення філогенетичних зв'язків між древніми еквідами ( плейстоценовий кінь, справжній тарпан) з використанням ISSR-PCR. Для досліджень використали коней породи коник польський з Яворівського національного природного парку та викопні рештки кісток коней плейстоценового періоду (близько 10 тис. р. до нашої ери). Генетичну структуру і міжпородну диференціацію провели за використання восьми ISSR- маркерних систем.
Отримані результати досліджень свідчать про високу ступінь консолідації коней породи коник польський на основі виявленого значення частки поліморфних локусів (P) і індексу інформаційного змісту поліморфізму (PIC).
Полілокусні спектри продуктів ампліфікації ділянки ISSR-PCR виявилися породоспецифічними для досліджених коней. За методом Нея (Nei, 1978) з використанням ISSR-маркерів розрахували генетичні відстані і встановили філогенетичні зв'язки між плейстоценовим конем, справжнім тарпаном та коником польським. Встановлено, що генетична відстань між коником польським і плейстоценовим конем становить DN = 0,0881, а між коником польським і справжнім тарпаном – DN= 0,0845, що свідчить про наявність філогенетичних зв’язків сучасних коней з древніми еквідами. У коня свійського (Equus саballus) виявлені видоспецифічні міжмікросателітні ділянки ДНК з розміром 380-400 пн та 500-520 пн.
Отже, генотипування спектрів продуктів ампліфікації з використанням міжмікросателітних праймерів дає змогу достатньо надійно виявляти міжпородні відмінності коней та встановлювати філогенетичні зв’язки між ними.
Посилання
Krokhmalna T.(1999). K istorii izucheniya drevnikh Equidae Ukrainy. [On the history of the study of the ancient Equidae of Ukraine.] Osnovni napryamky doslidzhenʹ, okhorony ta reintroduktsiyi u pryrodu konya Przhevalʹsʹkoho. Materialy VI Mizhnarodnoho sympoziumu. (pp. 109-114). ( Kyiv-Askania Nova, October 5-8), Askaniya Nova, pp. 109-114 (in Ukrainian).
Kurzenkov M. (2018). Pokhodzhennya ta domestykatsiya konya u doslidzhennyakh z molekulyarnoyi biolohiyi. [The origin and domestication of the horse in research in molecular biology]. Historical and political studies. 2018. No. 2 (63). P. 11–30. (in Ukrainian).
Kostenko S. O., Dzhus P. P., & Starodub L. F. (2017) Vydovi osoblyvosti polimorfizmu ta henomnoyi nestabilʹnosti svyni sviysʹkoyi (Sus scrofa) i velykoyi rohatoyi khudoby (Bos Taurus) za tsyto- ta DNK markeramy. [Species-specific features of polymorphism and genomic instability of domestic pig (Sus scrofa) and cattle cattle (Bos Taurus) by cyto- and DNA markers]. Kyiv: Printing Center "Comprint" (in Ukrainian).
Mokhnachova N., Starodub L., Dobryanska M.(2020). Optymizatsiya metodu vydilennya DNK z vykopnykh reshtok.[ Optimization of the method of DNA extraction from fossil remains]. Animal breeding and genetics.no 60, pp110 – 115. DOI: https://doi.org/10.31073/abg.60.01 (in Ukrainian).
Kandyba N. M. (2017) Henetyka: kurs lektsiy : navch. Posib. [Genetics: a course of lectures: teaching. Manual] Sumy: University book. (in Ukrainian).
TotalLab.(2020): http: // www.totallab.com (accessed: 04/01/2021).
GelQuest.(2017): http://www.sequentix.de/gelquest (accessed: 01.04.2021).
Gil M.I. (2015). Molekulyarna henetyka ta tekhnolohiya doslidzhennya henoma: navch. Posibnyk . [ Molecular genetics and genome research technology: training. Manual. navch. Posibnyk]. Kherson : OLDI –PLYUS (in Ukrainian).
Suprun I. O., Kurylenko Yu. F.(2014) Monitorynh henetychnoho polimorfizmu populyatsiy koney za vykorystannya ISSR –markeriv. Monitoring of genetic polymorphism of horse populations using ISSR markers. Bulletin of the Sumy National Agrarian University. Series 6 Livestock. Sumy, vol. 2/1 (24). pp. 181-186. (in Ukrainian).
Nei M. Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Genetics. 1978. Р. 583- 590. DOI: 10.1093/genetics/89.3.583.
Завантаження
Опубліковано
Номер
Розділ
Ліцензія
Стосунки між правовласниками і користувачами регулюються на умовах ліцензії Creative Commons Із Зазначенням Авторства – Некомерційна – Поширення На Тих Самих Умовах 4.0 Міжнародна (CC BY-NC-SA 4.0):https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/deed.uk
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
- Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див.The Effect of Open Access).
