Оцінка мультиплексного варіанту TaqMan REAL-TIME RT-PCR аналізу для виявлення пандемічного вірусу грипу A(H1N1)pdm в клінічних зразках хворих на грип
DOI:
https://doi.org/10.31548/dopovidi2016.05.006Ключові слова:
пандемічний вірус грипу A(H1N1)pdm, полімеразна ланцюгова реакція в режимі реального часу, діагностична тест-системаАнотація
Актуальність – сучасна діагностика пандемічних штамів вірусу грипу молекулярними методами. Мета – провести оцінку мультиплексного варіанту методу TaqMan Real-Time RT-PCR аналізу для швидкої та специфічної діагностики пандемічного вірусу грипу A(H1N1)pdm в клінічних зразках хворих на грип. Методи: Полімеразна ланцюгова реакція в режимі реального часу(Real-Time RT-PCR). Встановлено, що методика мультиплексного TaqMan Real-Time RT-PCR аналізу та розроблені праймери та TaqMan-зонди, що входять до складу вітчизняної тест-системи «DIA Influenza H1N1» здатні виявляти зі 100 % чутливістю та специфічністю РНК Каліфорнійських штамів пандемічного вірусу грипу A(H1N1)pdm серед клінічних зразків з сезонними штамами вірусу грипу. Аналітична чутливість тесту визначена на рівні 10 копій в реакції. Запропонована методика TaqMan Real-Time RT-PCR є ефективним інструментом швидкого та точного виявлення високопатогенних пандемічних штамів вірусу грипу A(H1N1)pdm 2009 року.
Посилання
European Centre for Disease Prevention and Control/WHO Regional Office for Europe. Flu News Europe, Joint ECDC-WHO. Available at: http://www.flunewseurope.org/Archives
Strategic advisory group of experts on immunization - report of the extraordinary meeting on the influenza A (H1N1) 2009 pandemic (7 July 2009); Human infection with pandemic A (H1N1) 2009 influenza virus: clinical observations in hospitalized patients, Americas (July 2009 - update) // Weekly Epidemiological Record (WHO).-2009.-84, N 30.-P. 301-308.
Mironenko A. P. Pandemia of influenza in Ukraine in 2009-2010 winter season: lessons learned for future / Mironenko A. P., Onishchenko O. V., Golubka O. S., Kurinko N. A., Leibenko L. V. // Liky Ukrainy. - 2010.- N 10 (146). - P. 86-90.
Leibenko L. V. Phylogenetic analysis of nfluenza A(H1N1) pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009-2010 pandemic season / Leibenko L. V., Polischuk V. P., Mironenko A. P. // Biopolymers and Cell. - 2013. - Vol. 29, N 2. - P. 143-149.
https://doi.org/10.7124/bc.000812
Hryp ta HRVI v Ukraini. Informatsiinyi biulleten. - Kyiv, 2016. - 19 s.
Analiz rozpovsiudzhennia ptashynoho hrypu H5N1 u sviti ta Ukraini u 2005. Informatsiino-analitychne povidomlennia. - 2010 rr. - Simferopol, 2011.
World Health Organization. WHO information for laboratory diagnosis of new influenza A (H1N1) virus in humans. Diagnostic Recommendations H1N1.200090521. Available at: http://www.who.int/csr/resources/publications/swineflu/WHO
Dreier J. Use of Bacteriohyage MS2 as an Internal Control in Viral Reverse transcription-PCR Assays. / Dreier, J., Stormer, M., Kleesiek, //J Clin Microbiol., K. 2005., 43(9), 4551-4557.
https://doi.org/10.1128/JCM.43.9.4551-4557.2005
WHO Recommendations: CDC protocol of real-time RT-PCR for influenza A(H1N1), revision 2 (6 October 2009). Available at: http://www.who.int/csr/resources/publications/swineflu/realtimeptpcr
Завантаження
Опубліковано
Номер
Розділ
Ліцензія
Стосунки між правовласниками і користувачами регулюються на умовах ліцензії Creative Commons Із Зазначенням Авторства – Некомерційна – Поширення На Тих Самих Умовах 4.0 Міжнародна (CC BY-NC-SA 4.0):https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/deed.uk
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
- Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див.The Effect of Open Access).
