Генотипова структура яєчних курей за мікросателітами ДНК
DOI:
https://doi.org/10.31548/poultry2020.11-12.016Ключові слова:
кури, мікросателіти, поліморфізм, ДНК, унікальні генотипиАнотація
Проаналізовано характер генотипового поліморфізму п’яти промислових кросів курей яєчного напряму продуктивності за п’ятьма мікросателітними локусами ДНК. За дослідженими локусами визначено 157 різних генотипових варіантів. Промислові кроси свійської курки Gallus domesticus вірогідно відрізнялись за розподілом генотипів по всіх досліджених локусах мікросателітів (Р<0,001). Найбільшу кількість генотипів виявлено у коричневих кросів. За локусами ADL268 та LEI094 найполіморфнішими були особини кросу «Хайсекс коричневий», а за рештою – «Ломанн коричневий». Найпоширенішим серед досліджуваних птахів є генотип MCW0248213/213 (відмічено у 129 особин). Цей же генотип є наймасовішим у кросу «Ломанн білий» (77 особин). У птиці кросів «Ломанн коричневий» та «Хай-Лайн W-98» наймасовішим є алель MCW0248213/217 (23 та 10 особин відповідно), у «Хайсекс білий» – MCW0248215/219 (42 особини), а у «Хайсекс коричневий» найчастіше зустрічаються генотипи MCW0248215/221 та MCW0248221/221 (у 13 особин кожен). Рідкісні генотипи було виявлено в усіх досліджених кросах, за виключенням генотипів, які зустрічались лише раз (Ng1) у кросу «Хайсекс білий». Зі 136 таких генотипів 73 зустрічались лише раз, а 63 – 2 рази. Найбільшу кількість рідкісних генотипів було зафіксовано у коричневих кросів за локусами LEI094 та MCW0248. Загалом, у досліджених кросів було виявлено 92 унікальних генотипи. З них 5 – зареєстровано за локусом ADL268 лише у кросу «Хайсекс коричневий». За локусом MCW0216 було виявлено 14 унікальних генотипів: серед курей кросу «Хайсекс коричневий» – 7, «Ломанн коричневий» – 5, «Ломанн білий» та «Хай-Лайн W-98» – по одному такому генотипу, серед особин кросу «Хайсекс білий» – жодного. Унікальні генотипи за локусом LEI094 було виявлено 31 раз. Серед особин кросів «Ломанн коричневий» та «Хайсекс коричневий» було відмічено по 12 таких генотипів, а серед курей кросу «Ломанн білий» – 4. Крос «Ломанн білий» виявив високий рівень консолідованості за певними генотипами по кожному з досліджених мікросателітних локусів. Так, генотип ADL0278108/114 зустрічався у 40% випадків, ADL0268108/110 – 50%, LEI094259/259 – 58%, MCW248213/213 – 77% і MCW216137/137 – 84%. Причому останні 3 – гомозиготні.Посилання
Borodai, V.P., Ponomarenko, N.P., Melnyk,V.V., Shelov, A.V., Spyrydonov, V.H. & Melnychuk, S.D. (2012). Rekomendatsii shchodo provedennia henetychnoi otsinky populiatsii kurei spetsializovanykh yaiechnykh krosiv iz zastosuvanniam DNK-markeriv [Recommendations for genetic assessment of populations of chickens specialized egg crosses using DNA markers]. Kyiv.: TOV «Ahrar Media Hrup». [in Ukrainian].
Chao, A. (1984). Nonparametric estimation of the number of classes in a population. Scandinavian Journal of Statistics, 11. 265-270. [in English].
Chen, G., Bao, W., Shu, J., Ji, C., Wang, M. & Eding H. (2008). Assessment of population structure and genetic diversity of 15 Chinese indigenous chicken breeds using microsatellite markers. Asian-Aust J Anim. Sci., 21 (3), 331-339. https://doi.org/10.5713/ajas.2008.70125
FAO, 2011. Molecular genetic characterization of animal genetic resources. Food and Agriculture Organization of the United Nations Publ., Rome, Italy. [in English].
Maharani, D., Hariyono, D. N. H., Cho, S., Manjula, P., Seo, D., Choi, N., Sidadolog, J. H. P. & Lee, J. H. (2017). Genetic diversity among Indonesian local duck populations in Java Island assessed by microsatellite markers. Journal of Animal Breeding and Genomics, 1 (2), 136-142. [in English]. https://doi.org/10.12972/jabng.20170013
Novgorodova, I. P., Zinoveva, N. A., Gladyr, E. A. & Fisinin, V. I. (2016). Analiz geneticheskogo raznoobrazija dekorativnyh porod kur na osnove mikrosatellitnyh markerov [Analysis of the genetic diversity of ornamental chicken breeds based on microsatellite markers]. Dostizhenija nauki i tehniki APK [Achievements of science and technology of the agro-industrial complex], 30 (1), 69-71. [in Russian].
Peakall, R., Smouse, P. E. (2012). GenAIEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research - an update. Bioinformatics, 28, 2537-2539. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bts460
Завантаження
Опубліковано
Номер
Розділ
Ліцензія
Стосунки між правовласниками і користувачами регулюються на умовах ліцензії Creative Commons Із Зазначенням Авторства – Некомерційна – Поширення На Тих Самих Умовах 4.0 Міжнародна (CC BY-NC-SA 4.0):https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/deed.uk
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
- Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див.The Effect of Open Access).