Особливості генетико-популяційних параметрів українських локальних порід курей за локусом TLR4

Автор(и)

  • L.V. Shulika Institute of Animal NAAS , Інститу тваринництва НААН
  • R.O. Kulibaba Національний університет біоресурсів і природокористування України image/svg+xml
  • Yu.V. Liashenko Institute of Animal NAAS , Інститу тваринництва НААН
  • G.I. Sakhatsky Приазовський державний технічний університет image/svg+xml

DOI:

https://doi.org/10.31548/poultry2020.09-10.011

Ключові слова:

поліморфізм, ДНК-маркери, TLR4, кури, локальні породи, бірківська барвиста, полтавська глиняста

Анотація

Раціональне використання генетичних ресурсів локальних порід сільськогосподарських тварин у межах концепції сталого розвитку неможливе без попереднього їх аналізу. Наразі для оцінки генетичних особливостей порід, ліній та популяцій широко використовують ДНК-маркери господарськи корисних ознак. Використання у якості ДНК-маркерів мутацій цільових генів, окрім безпосередньо оцінки генетичних ресурсів, дає підґрунтя для маркер-асоційованої селекції. Одним із перспективних цільових генів, що може розглядатися у контексті підвищення резистентності курей до бактеріальних захворювань, є ген Toll-подібного рецептора TLR4.

Проаналізовано особливості генетико-популяційних параметрів локальних українських порід курей (бірківська барвиста і полтавська глиняста) за локусом TLR4, а саме, за мутацією G3954C, з використанням методу ПЛР-ПДРФ. У результаті в дослідних популяціях виявлено обидва альтернативні алелі – A і B, та всі можливі варіанти генотипів. В обох породах за частотою переважав алель B (0,90 – для бірківської барвистої; 0,63 – для полтавської глинястої). Частота алеля A склала для породи бірківська барвиста 0,10; для полтавської глинястої – 0,37. Частота генотипів AA, AB і BB виявилась наступною: 0,02; 0,16 і 0,82 для бірківської барвистої; 0,12; 0,50 і 0,38 для полтавської глинястої, відповідно. З’ясовані відмінності між породами за частотами генотипів та алелів статистично достовірні (P ≤ 0,01). Обидві дослідні популяції курей за локусом TLR4 перебувають у стані генетичної рівноваги. Для породи полтавська глиняста виявилися характерними високі рівні фактичної та очікуваної гетерозиготності, тоді як для бірківської барвистої дані показники були значно нижчими. Рівні індексу фіксації Райта були невисокими для обох порід, але у випадку бірківської барвистої вони вказували на незначний дефіцит гетерозигот, а у випадку полтавської глинястої, навпаки, на їх "надлишок". Значення показника ефективного числа алелів становили 1,22 (бірківська барвиста) і 1,87 (полтавська глиняста). Виявлені особливості генетико-популяційних показників дослідних порід можуть бути обумовлені різницею їхнього походження та напряму продуктивності.

Посилання

Fulton, J.E. (2012). Genomic selection for poultry breeding. Animal Frontiers, 2 (1), 30-36.

https://doi.org/10.2527/af.2011-0028.

Hlestkina, E.K. (2013). Molekuljarnye markery v geneticheskih issledovanijah i v selekcii [Molecular markers in genetic studies and in selection]. Vavilovskij zhurnal genetiki i selekcii [Vavilov Journal of Genetics and Selection], 17 (4/2), 1044-1054 [in Russian].

Kopylov, K., Metlitska, O., Mohnachоva, N., Suprovych, T. (2016). Molekuliarno-henetychnyi monitorynh u systemi zberezhennia henetychnykh resursiv tvaryn [Molecular-genetic monitoring in system of preservation of genetic resources of animals]. Visnyk ahrarnoi nauky [News of agrarian sciences], 6, 43-47 [in Ukrainian]. https://doi.org/10.31073/agrovisnyk201606-09

Kulibaba, R.A., Podstreshnyi, A.P. (2012). Prolactin and growth hormone gene polymorphisms in chicken lines of Ukrainian selection. Cytology and Genetics,46 (6), 390-395.

https://doi.org/10.3103/S0095452712060060.

Kulibaba, R.A. (2015). Polymorphism of growth hormone, growth hormone receptor, prolactin and prolactin receptor genes in connection with egg production in Poltava Clay chicken. Agricultural Biology, 50 (2), 198-207. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2015.2.198eng.

Kuznecov, V.M. (2014). F-statistiki Rajta: ocenka i interpretacija [Wright's F-statistics: evaluation and interpretation]. Problemy biologii produktivnyh zhivotnyh [The problems of the biology of productive animals]. 4. 80-104. [in Russian].

Lakin, G.F. (1990). Biometrija [Biometrics] (4th ed, rev.). Moscow: Vysshaja shkola, 352 [in Russian].

Li, H.F., Hu, Y., Hu, H., Song, C., Shu, J.T., Zhu, C.H., Zhang, S.J., Fan, J.H., Chen, W.W. (2013). Genetic differ in TLR4 gene polymorphisms and expression involved in Salmonella natural and artificial infection respectively in Chinese native chicken breeds. Mol Biol Rep, 40, 5005-5012.

https://doi.org/10.1007/s11033-013-2601-8.

Malek, M., Hasenstein, J.R., Lamont, S.J. (2004). Analysis of chicken TLR4, CD28, MIF, MD-2, and LITAF genes in a Salmonella enteritidis resource population. Poultry Science, 83,544-549. [in English]. https://doi.org/10.1093/ps/83.4.544

Merkur'eva, E.K. (1977). Geneticheskie osnovy selekcii v skotovodstve [Genetic basis of selection in cattle breeding]. Moscow: Kolos, 240 [in Russian].

Riabokon, Yu.O. (Ed.). (2006). Kataloh pleminnykh resursiv silskohospodarskoi ptytsi Ukrainy [Catalog of breeding resources of poultry]. Kyiv: Atmosfera, 80 [in Ukrainian].

Rischkowsky, B. & Pilling, D. (Eds.). (2007). The State of the World's Animal Genetic Resources for Food and Agriculture. Rome, Italy: FAO, 512 [in English].

Shuplyk, V.V., Savchuk, O.V., Huziev, I.V., Fedorovych, V.V., Liubynskyi, O.I., Fedorovych, Ye.I. (2013). Henofond porid silskohospodarskykh tvaryn Ukrainy [Gene pool of farm animals breeds of Ukraine]. Kamianets-Podilskyi, PP Zvoleiko D.H., 352 [in Ukrainian].

Song, Y.M. , Pang, J.J., Zhao, G.P., Liu, R.R., Li, P., Zhao, X.W., Zheng, M.Q., Wen, J. (2010). Identification of single nucleotide polymorphisms of TLR4 and evaluation of the population genetic variance in Chinese and overseas chickens. Chinese Agricultural Science Bulletin, 16, 1-7. [in Chinese].

Завантаження

Опубліковано

2021-03-23

Номер

№ 9-10 (2020)

Розділ

Селекція і генетика

Ліцензія

Стосунки між правовласниками і користувачами регулюються на умовах ліцензії Creative Commons Із Зазначенням Авторства – Некомерційна – Поширення На Тих Самих Умовах 4.0 Міжнародна (CC BY-NC-SA 4.0):https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/deed.uk

Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:

  • Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
  • Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
  • Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див.The Effect of Open Access).