Аналіз поширення SARS-CoV-2 у світі серед різних видів тварин



DOI: http://dx.doi.org/10.31548/dopovidi.3(109).2024.016

A. V. Molozhanova

Анотація


У даній статті представлені результати епізоотологічного аналізу даних сучасної, переважно іноземної, наявної інформації щодо виникнення та поширення SARS-CoV-2 серед різних видів  тварин.  Використовували офіційні дані Держпродспоживслужби України та офіційні дані організації Всесвітньої охорони здоров'я тварин (МЕБ). Також було проведено аналіз доступної інформації опублікованої іноземними та вітчизняними вченими стосовно випадків захворювання та позитивних результатів досліджень на COVID-19 серед тварин.

SARS-CoV-2 став найбільшою глобальною катастрофою в галузі охорони здоров’я з часів пандемії грипу 1918 року відомого як «іспанський грип», створивши безпрецедентну загрозу для всього людства, завдавши колосальних збитків світовій економіці.

За останні два десятиліття спалахи коронавірусу викликали занепокоєння у всьому світі, включи випадки з важким гострим респіраторним синдромом (SARS), що зареєстрований у Китаї в 2003 році. Та спалах у 2012 році з Близькосхідним респіраторним синдромом (MERS). Коронавіруси, такі як MERS-CoV і SARS, разом із лихоманкою Ебола та грипом перебувають у списках інфекцій із пандемічним потенціалом .

Коронавіруси спричиняють велику різноманітність захворювань у тварин, і їхня здатність викликати важкі захворювання худоби, таких як свині, корови, кури, собаки та коти, призвела до значних досліджень цих вірусів у останній половині двадцятого століття.

Широкий спектр видів ссавців продемонстрував сприйнятливість через експериментальне зараження та в природних умовах під час тісного контакту з інфікованими людьми та іншими інфікованими тваринами. Але зафіксовано випадки коли люди можуть передати SARS-CoV-2 тваринам, особливо під час близького контакту. Такі випадки інфікування тварин SARS-CoV-2 було задокументовано по всьому світу. Більшість цих тварин заразилися після контакту з людьми з COVID-19, включаючи власників, доглядачів або інших осіб, які були в тісному контакті.


Ключові слова


COVID 19; SARS-CoV-2 ; SARS; MERS

Повний текст:

PDF

Посилання


Wu F. et al. (2020). A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature, 579,, 265–269.

Zhou P. et al. (2020). A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature, 270–273.

Jeffery K. Taubenberger, John C. Kash, David M. Morens. (2019). The 1918 influenza pandemic: 100 years of questions answered and unanswered. Sci Transl Med. 24;11(502):eaau5485. doi: 10.1126/scitranslmed.aau5485.

Latinne, A., Hu, B., Olival, K. J., Zhu, G., Zhang, L., Li, H., Chmura, A. A., Field, H. E., Zambrana-Torrelio, C., Epstein, J. H., Li, B., Zhang, W., Wang, L.-F., Shi, Z.-L., & Daszak, P. (2020). Origin and cross-species transmission of bat coronaviruses in China. Nature Communications, 11(1). https://doi.org/10.1038/s41467-020-17687-3

World Health Organization https://www.who.int/

Kumar D., Batra L., Malik M.T.(2020). Insights of Novel Coronavirus (SARS-CoV-2) disease outbreak, management and treatment. AIMS Microbiol. 6(3):183-203. doi: 10.3934/microbiol.2020013.

Da Silva, P.G., Mesquita, J.R., de São José Nascimento, M., & Ferreira, V.A.M. (2020). Viral, host and environmental factors that favor anthropozoonotic spillover of coronaviruses: an opinionated review, focusing on SARS-CoV, MERS-CoV and SARS-CoV-2. Sci Total Environ., 750, 141483. 10.1016/j.scitotenv.2020.141483.

Severe acute respiratory syndrome (SARS): SARS basics fact sheet. Available at: https://www.cdc.gov/sars/about/fs-sars.html (Accessed 2022-09-04). CDC. 2022.

Rabaan A.A., Al-Ahmed S.H., Haque S., Sah R., Tiwari R., Malik Y.S., Dhama K., Yatoo M.I., Bonilla-Aldana D.K., (2020). SARS-CoV-2, SARS-CoV, and MERS-COV: A comparative overview. Infez Med. 28(2):174-184.

Mahmoud Kandeel, Abdelazim Ibrahim, Mahmoud Fayez, Mohammed Al-Nazawi.(2020). From SARS and MERS CoVs to SARS-CoV-2: Moving toward more biased codon usage in viral structural and nonstructural genes. J Med Virol, 92(6):660-666. doi: 10.1002/jmv.25754.

Peeri, N.C., Shrestha, N., Rahman, M.S., Zaki, R., Tan, Z., Bibi, S., Baghbanzadeh, M., Aghamohammadi, N., Zhang, W., & Haque, U. (2020). The SARS, MERS and novel coronavirus (COVID-19) epidemics, the newest and biggest global health threats: what lessons have we learned? Int J Epidemiol., 49(3), 717-726. doi: 10.1093/ije/dyaa033.

Liya G., Yuguang W., Jian L., Huaiping Y., Xue H., Jianwei H., Jiaju M., Youran L., Chen M., Yiqing J.(2020). Studies on viral pneumonia related to novel coronavirus SARS-CoV-2, SARS-CoV, and MERS-CoV: a literature review. APMIS,

(6):423-432. doi: 10.1111/apm.13047.

Feshchenko, Y.I. National Institute of Phthisiology and Pulmonology named after F.G. Yanovsky NAMS of Ukraine, Kyiv.(2020). Viral load as a marker of the risk of severe course and progression of COVID-19: a review. Infusion & Chemotherapy, (2), 5-10. https://doi.org/10.32902/2663-0338-2020-2-5-10.

Zhang, Y.Z., & Holmes, E.C. (2020). A genomic perspective on the origin and emergence of SARS-CoV-2. Cell, 181:223–227.

Adriaan H de Wilde, Eric J Snijder, Marjolein Kikkert , Martijn J van Hemert (2018). Host Factors in Coronavirus Replication. Curr. Top. Microbiol. Immunol. 419, 1–42. doi: 10.1007/82_2017_25 |

Ghosh, P., Jayaram, S., Patwardhan, D., Marimuthu, S., Lenehan, P., Venkatakrishnan, A., et al. (2021). Diversity of coronavirus receptors. 2021080071. doi: 10.20944/preprints202108.0071.v1

KATHY KATELLA JANUARY 6, (2023). 9 Things Everyone Should Know About the Coronavirus Outbreak https://www.yalemedicine.org/news/2019-novel-coronavirus

Li, X., Zai, J., Zhao, Q., Nie, Q., Li, Y., Foley, B. T., et al. (2020). Evolutionary history, potential intermediate animal host, and cross-species analyses of SARS-CoV-2. J. Med. Virol. 92 (6), 602–611. doi: 10.1002/jmv.25731

Walls, A. C., Park, Y. J., Tortorici, M. A., Wall, A., Mcguire, A. T., Veesler, D. (2020). Structure, function and antigenicity of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein. Cell 181 (2), 281–292. doi: 10.1016/j.cell.2020.02.058

Qian Li, Taif Shah, Binghui Wang, Linyu Qu, Rui Wang, Yutong Hou, Zulqarnain Baloch, Xueshan Xia. (2023) Cross-species transmission, evolution and zoonotic potential of coronaviruses. https://doi.org/10.3389/fcimb.2022.1081370

Banerjee, A.; Doxey, A.C.; Mossman, K.; Irving, A.T. (2021). Unraveling the zoonotic origin and transmission of SARS-CoV-2. Trends Ecol. Evol. 36, 180–184.

Shereen, M.A.; Khan, S.; Kazmi, A.; Bashir, N.; Siddique, R. (2020). COVID-19 infection: Origin, transmission, and characteristics of human coronaviruses. J. Adv. Res. 24, 91–98.

Ye, Z. W., Yuan, S., Yuen, K. S., Fung, S. Y., Jin, D. Y. (2020). Zoonotic origins of human coronaviruses. Int. J. Biol. Sci. 16 (10), 1686–1697. doi: 10.7150/ijbs.45472

Worobey, M., Levy, J. I., Malpica Serrano, L., Crits-Christoph, A., Pekar, J. E., Goldstein, S. A., et al. (2022). The huanan seafood wholesale market in wuhan was the early epicenter of the COVID-19 pandemic. Science 377 (6609), 951–959. doi: 10.1126/science.abp8715

Monica Guy, (2020). Coronavirus: a wake-up call on illegal wildlife trade? Basel Institute on Governance. https://baselgovernance.org/blog/coronavirus-wake-call-illegal-wildlife-trade

A.; Shereen, M.A.; Khan, S.; Kazmi Bashir, N.; Siddique, R. (2020). COVID-19 infection: Origin, transmission, and characteristics of human coronaviruses. J. Adv. Res., 24, 91–98.

Hidalgo P., Valdés M., González R.A.(2021). Molecular biology of coronaviruses: an overview of virus-host interactions and pathogenesis. Bol Med Hosp Infant Mex, 78(1):41-58. doi: 10.24875/BMHIM.20000249.

Emily Clayton, Mohammed A. Rohaim, Mahmoud Bayoumi, Muhammad Munir. (2021). The Molecular Virology of Coronaviruses with Special Reference to SARS-CoV-2. Adv Exp Med Biol, 2021:1352:15-31. doi: 10.1007/978-3-030-85109-5_2.

Xue-Yan Zhang, Hao-Jie Huang, Dong-Lin Zhuang, Moussa Ide Nasser, Ming-Hua Yang, Ping Zhu, Ming-Yi Zhao. (2020) Biological, clinical and epidemiological features of COVID-19, SARS and MERS and AutoDock simulation of ACE2. Infect Dis Poverty. 9: 99. DOI: 10.1186/s40249-020-00691-6

Pickering, B.S.; Smith, G.; Pinette, M.M.; Embury-Hyatt, C.; Moffat, E.; Marszal, P.; Lewis, C.E. (2021). Susceptibility of Domestic Swine to Experimental Infection with Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2. Emerg. Infect. Dis. 27, 104–112.

Magtoto, R., Poonsuk, K., Baum, D., Zhang, J., Chen, Q., Ji, J., Piñeyro, P., Zimmerman, J., & Giménez-Lirola, L. G. (2019). Evaluation of the Serologic Cross-Reactivity between Transmissible Gastroenteritis Coronavirus and Porcine Respiratory Coronavirus Using Commercial Blocking Enzyme-Linked Immunosorbent Assay Kits. ASM Journals, 4(2). https://doi.org/10.1128/mSphere.00017-19

Saipeng Cheng, Huiguang Wu, and Zhenhai Chen (2020). Evolution of transmissible gastroenteritis virus (TGEV): A codon usage perspective. International Journal of Molecular Sciences 21 (21). doi: 10.3390/ijms21217898

Li Z., Chen Y., Li L., Xue M., Feng L.(2024). Different Infectivity of Swine Enteric Coronaviruses in Cells of Various Species. Pathogens, 15;13(2):174. doi: 10.3390/pathogens13020174.

Turlewicz-Podbielska, H., & Pomorska-Mól, M. (2021). Porcine Coronaviruses: Overview of the State of the Art. Virologica Sinica, 36(5), 833–851. https://doi.org/10.1007/s12250-021-00364-0

Li, G., Zhai, S. L., Zhou, X., Chen, T. B., Niu, J. W., Xie, Y. S., et al. (2022). Phylogeography and evolutionary dynamics analysis of porcine delta-coronavirus with host expansion to humans. Transbound Emerg. Dis. 69 (5), 1670–1681. doi: 10.1111/tbed.14503

Liu, Q., Wang, H. Y. (2021). Porcine enteric coronaviruses: an updated overview of the pathogenesis, prevalence, and diagnosis. VETERINARY Res. Commun. 45 (2-3), 75–86. doi: 10.1007/s11259-021-09808-0

G Tekes 1, H-J Thiel. (2016) Feline Coronaviruses: Pathogenesis of Feline Infectious Peritonitis. Adv Virus Res, 96:193-218. doi: 10.1016/bs.aivir.2016.08.002.

Islam, A., Ferdous, J., Islam, S., Abu Sayeed, M., Choudhury, S. D., Saha, O., et al. (2021). Evolutionary dynamics and epidemiology of endemic and emerging coronaviruses in humans, domestic animals, and wildlife. Viruses 13 (10). doi: 10.3390/v13101908

Giovanni Franzo, Michele Drigo, Matteo Legnardi, Laura Grassi, Daniela Pasotto, Maria Luisa Menandro, Mattia Cecchinato, Claudia Maria Tucciarone. (2020). Bovine Coronavirus: Variability, Evolution, and Dispersal Patterns of a No Longer Neglected Betacoronavirus. Viruses,12(11):1285. doi: 10.3390/v12111285.

Vlasova, A. N., Saif, L. J. (2021). Bovine coronavirus and the associated diseases. Front. Veterinary Sci. 8, 643220. doi: 10.3389/fvets.2021.643220

Zhu, Q., Li, B., Sun, D. (2022). Advances in bovine coronavirus epidemiology. Viruses 14 (5). doi: 10.3390/v14051109

Alhamo, M. A., Boley, P. A., Liu, M., Niu, X., Yadav, K. K., Lee, C., et al. (2022). Characterization of the cross-species transmission potential for porcine deltacoronaviruses expressing sparrow coronavirus spike protein in commercial poultry. Viruses 14 (6). doi: 10.3390/v14061225

H.M. Stone, E. Unal, T. A. Romano, P. E. Turner. (2023). Beluga whale and bottlenose dolphin ACE2 proteins allow cell entry mediated by spike protein from three variants of SARS-CoV-2. Biol Lett. 19(12):20230321. doi: 10.1098/rsbl.2023.0321.

Cerri A, Bolatti E.M., Zorec T.M., Montani M.E., Rimondi A., Hosnjak L., Casal P.E., Di Domenica V., Barquez R.M., Poljak M., Giri A.A. (2023). Identification and characterization of novel alphacoronaviruses in Tadarida brasiliensis (Chiroptera, Molossidae) from Argentina: insights into recombination as a mechanism favoring bat coronavirus cross-species transmission. Microbiol Spectr, 11(5):e0204723. doi: 10.1128/spectrum.02047-23.

Wong, A. C. P., Lau, S. K. P., Woo, P. C. Y. (2021). Interspecies jumping of bat coronaviruses. Viruses 13 (11). doi: 10.3390/v13112188

Nga PT, Parquet Mdel C, Lauber C et al (2011) Discovery of the first insect nidovirus, a missing evolutionary link in the emergence of the largest RNA virus genomes. PLoS Pathog 7:e1002215. doi:10.1371/journal.ppat.1002215

Lauber C, Ziebuhr J, Junglen S et al (2012) Mesoniviridae: a proposed new family in the order Nidovirales formed by a single species of mosquito-borne viruses. Arch Virol 157:1623–1628. doi:10.1007/s00705-012-1295-x

Connor Rutherford, Pratap Kafle, Catherine Soos, Tasha Epp, Lori Bradford, and Emily Jenkins. (2022) Investigating SARS-CoV-2 Susceptibility in Animal Species: A Scoping Review. Environmental Health Sage Journals 16, https://doi.org/10.1177/11786302221107786.

Shi, J.;Wen, Z.; Zhong, G.; Yang, H.;Wang, C.; Huang, B.; Liu, R.; He, X.; Shuai, L.; Sun, Z.; et al.(2020). Susceptibility of ferrets, cats, dogs, and other domesticated animals to SARS–coronavirus 2. Science, 368, 1016–1020.

Mathavarajah, S.; Dellaire, G. (2020). Lions, tigers and kittens too: ACE2 and susceptibility to COVID-19. Evol. Med. Public Health, 109–113.

Ali Mohammad Pourbagher‑Shahri, Gholamreza Mohammadi, Hamed Ghazavi, Fatemeh Forouzanfar (2023). Susceptibility of domestic and companion animals to SARS‑CoV‑2: a comprehensive review. Tropical Animal Health and Production, 55, article number 60 https://doi.org/10.1007/s11250-023-03470-1

Abdel-Moneim, A. S., & Abdelwhab, E. M. (2020). Evidence for SARS-CoV-2 infection of animal hosts. Pathogens, 9(7), 529. http://dx.doi.org/10.3390/pathogens9070529. PMid:32629960.

Csiszar, A., Jakab, F., Valencak, T. G., Lanszki, Z., Tóth, G. E., Kemenesi, G., et al. (2020). Companion animals likely do not spread COVID-19 but may get infected themselves. GeroScience 42 (5), 1229–1236. doi: 10.1007/s11357-020-00248-3

Smriti Mallapaty (2020). Coronavirus can infect cats—dogs, not so much. Nature, 27(5):1362-1370, doi: 10.1038/d41586-020-00984-8

Oguzoglu, T. C., Koc, B. T., Akkutay-Yoldar, A. Z. (2021). Triple viral infections in the same cats: Feline coronavirus, feline parvovirus, feline foamy virus. Rev. MVZ CORDOBA 26 (3). doi: 10.21897/rmvz.2182

Shi J, Wen Z, Zhong G, Yang H, Wang C, Huang B, et al. (2020). Susceptibility of ferrets, cats, dogs, and other domesticated animals to SARS-coronavirus 2. Science. 368:1016–20. 10.1126/science.abb7015

Bosco-Lauth A.M., Hartwig A.E., Porter S.M., Gordy P.W., Nehring M, Byas A.D., et al. (2020). Experimental infection of domestic dogs and cats with SARS-CoV-2: pathogenesis, transmission, and response to reexposure in cats. Proc Natl Acad Sci USA. 117:26382–8. 10.1073/pnas.2013102117

Sit THC, Brackman C.J., Ip S.M., Tam KWS, Law PYT, To EMW, Yu VYT, et al. (2020). Infection of dogs with SARS-CoV-2. Nature. 586:776–8. 10.1038/s41586-020-2334-5

Zhai X, Sun J, Yan Z, Zhang J, Zhao J, Zhao Z, et al. (2020). Comparison of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 spike protein binding to ACE2 receptors from human, pets, farm animals, and putative intermediate hosts. J Virol. 94:e00831–20. 10.1128/jvi.00831-20

OIE. COVID-19 (SARS-COV-2), Hong Kong (SAR - PRC) (2020). Available online:https://www.oie.int/wahis_2/public/wahid.php/Reviewreport/Review?page_refer=MapFullEventReport&reportid=33546 (accessed on 22 June 2020).

AFCD. A Second Dog Positive for COVID-19; AFCD, Ed.; Agriculture, Fisheries and Conservation Department: Hong Kong, (2020). Available online: https://www.info.gov.hk/gia/general/202003/19/P2020031900606.htm (accessed on 22 June 2020).

Tuhin Dasa, Suranjana Sikdara, Md. Helal Uddin Chowdhuryb, Khandakar Jannatul Nymaa, Md. Adnan (2023). SARS-CoV-2 prevalence in domestic and wildlife animals: A genomic and docking based structural comprehensive review. Heliyon 9(2020):e19345 DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e19345.

Hannah L. Murphy (2021). Understanding the prevalence of SARS-CoV-2 (COVID-19) exposure in companion, captive, wild, and farmed animals. Accepted 18. https://doi.org/10.1080/21505594.2021.1996519

Dillon S. McBride, Sofya K. Garushyants, John Franks, Andrew F. Magee, Steven H. Overend, Devra Huey, Amanda M. Williams, Seth A. Faith, Ahmed Kandeil, (2023). Accelerated evolution of SARS-CoV-2 in free-ranging white-tailed. 14(1):5105. doi: 10.1038/s41467-023-40706-y.

USDA APHIS. Confirmation of COVID-19 in deer in Ohio. https://www.aphis.usda.gov/aphis/newsroom/stakeholder-info/sa_by_date/sa-2021/sa-08/covid-deer (2021).

USDA APHIS. Confirmed cases of SARS-CoV-2 in animals in the United States. https://www.aphis.usda.gov/aphis/ourfocus/onehealth/one-health-sarscov2-in-animals.

World Organisation for Animal Health. SARS-CoV-2 in Animals - Situation Report (2022). https://www.woah.org/app/uploads/2023/01/sars-cov-2-situation-report-20.pdf

Damas, J. et al. (2020). Broad host range of SARS-CoV-2 predicted by comparative and structural analysis of ACE2 in vertebrates. Proc. Natl Acad. Sci. USA 117, 22311–22322


Метрики статей

Завантаження метрик ...

Metrics powered by PLOS ALM

Посилання

  • Поки немає зовнішніх посилань.


Bookmark and Share